Sutter Instruments Company
Sutter Instrument SutterPatch
 
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  Sutter Instrument
Sistemas de Amplificadores
dPATCH®
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Software
SutterPatch®

  SutterPatch®
Adquisición de datos,
Software de Gestión y Análisis
El software SutterPatch® es una aplicación de análisis, gestión y adquisición de datos de electrofisiología con funciones completas para computadoras con Windows o Mac OS, respaldada por nuestro legendario soporte técnico gratuito. SutterPatch viene incluido con todos los sistemas de amplificador de Patch Clamp Sutter Instrument. El software controla la adquisición de datos, proporciona mediciones en tiempo real para ayudar en la toma de decisiones durante el experimento, realiza un seguimiento de todos los parámetros del amplificador, registra el progreso experimental y almacena un conjunto de hasta 600 parámetros de metadatos. Construido dentro de la última versión de Igor Pro por WaveMetrics, Inc., SutterPatch brinda acceso inmediato a las poderosas herramientas de análisis científico y de ingeniería de Igor. SutterPatch se está expandiendo y desarrollando activamente a diario, con el objetivo de convertirse en el estándar para la electrofisiología en todo el mundo.

La versión 2 del software SutterPatch agrega soporte para el nuevo sistema amplificador de parche digital dPatch®, así como una multitud de nuevas funciones y mejoras en la interfaz de usuario que también se aplican a la familia de sistemas amplificadores IPA. Se han actualizado la prueba de membrana y el funcionamiento libre. Los nuevos controles deslizantes triples y de matriz 2D facilitan los ajustes de compensación en el panel de control del amplificador.

Se puso especial énfasis en la navegación intuitiva a través de grandes conjuntos de datos. Los controles que son familiares del software de electrofisiología o aplicaciones en otros campos, así como los enfoques completamente nuevos, hacen que encontrar una sección particular de un experimento sea muy fácil.

La arquitectura estructurada de los archivos de datos fue diseñada para retener el contexto de cada muestra dentro de un experimento. Con poco esfuerzo al comienzo de un experimento, se registra una gran cantidad de parámetros de metadatos, de forma automática cuando es posible, configurados por el usuario cuando lo desea. Cada parámetro se puede revisar antes de ejecutar un Paradigma o Rutina.

El software SutterPatch viene con una colección de ejemplos de paradigmas y rutinas que facilitan la configuración de escenarios experimentales comúnmente ejecutados.

SutterPatch proporciona capacidad de análisis en tiempo real que crea automáticamente gráficos como curvas I-V o un gráfico de curso de tiempo mientras el experimento está en progreso. Se pueden mostrar hasta 8 gráficos de análisis, cada uno derivado de 16 medidas posibles de las señales de entrada. Los análisis incluyen la media, la pendiente, el tiempo de subida, la frecuencia de cruce del umbral, etc. Esto facilita la toma de decisiones sobre el curso posterior de un experimento.

Además del análisis en tiempo real, SutterPatch admite procesamiento adicional después del experimento para los procedimientos de análisis más sofisticados. SutterPatch agrega capacidades específicas de la aplicación además del amplio conjunto de funciones de análisis que es nativo de Igor Pro. Las Ecuaciones y Variables facilitan el uso de algoritmos más complejos tanto en Rutinas como en Paradigmas.
C A R A C T E R Í S T I C A S   D E   S U T E R P A T C H
  • Compatibilidad con todos los sistemas de amplificación de instrumentos de Sutter, incluido el nuevo sistema de grabación de Patch Clamp digital dPatch®
  • Scope Window proporciona una navegación intuitiva y eficiente a través de sus datos
    • Botones de control de zoom y controles deslizantes
    • Arrastre a lo largo del eje para acercar
    • Zoom con la rueda del ratón
    • Zoom de marquesina
    • Barras de desplazamiento
    • Escalado automático continuo y de instantáneas
    • Barrido, curso de tiempo y visualización concatenada
    • Nueva pantalla 3D
    • Navegador de descripción general único para el examen panorámico y el movimiento conveniente dentro de una sección de datos
    • La ventana Paradigm Review brinda acceso rápido a los datos de rutina individuales
  • La prueba de membrana realiza un seguimiento de la salud celular y otros parámetros de control de calidad
    • Los tipos de formas de onda incluyen pulsos dobles, trenes sinusoidales y triangulares y medición instantánea de ruido RMS
    • Visualización simultánea de hasta dos amplificadores o señales de entrada auxiliares y una forma de onda de comando
    • Parámetros de pulso de prueba totalmente configurables
    • Promedio de pulso
    • Monitor de sonido
  • Las rutinas controlan la adquisición de datos con o sin aplicación de formas de onda de comando
    • Grupo de rutinas de muestra con paradigmas preconfigurados para muchas aplicaciones comunes
    • Las señales cableadas del hardware de Sutter Instrument y las señales de entrada auxiliares se graban
    • La señal de comando aplicada a la celda es monitoreada y registrada
    • Las señales de salida analógicas y digitales controlan la información periférica y de terceros
    • Hasta 50 segmentos por barrido para una máxima flexibilidad en la configuración de las formas de onda de comando más complejas
    • Formas de segmento preconfiguradas como Sine, Square y Chirp para facilitar el diseño de formas de onda
    • La plantilla de forma de onda permite la "reproducción" de una señal grabada en una celda o la aplicación de una expresión matemática como una forma de onda
    • Las mediciones proporcionan la base para el análisis en tiempo real y permiten la toma de decisiones en el transcurso del experimento.
  • Los paradigmas permiten la automatización de procesos y eliminan el sesgo del operador
    • Sample Paradigm Pool con Paradigmas preconfigurados para muchas aplicaciones comunes
    • Configure el amplificador con ajustes estándar reproducibles
    • La adquisición de secuencias de rutina permite la experimentación planificada previamente y minimiza el sesgo del operador
    • Control de flujo para la toma de decisiones interactiva o automatizada durante el experimento
    • Chaining Paradigms proporciona mayor flexibilidad
    • Creación automática de Layouts para documentación estandarizada
    • El Editor de soluciones le permite realizar un seguimiento de las soluciones y los compuestos y admite el control directo de un conmutador de soluciones.
      • Las condiciones iniciales y todos los cambios de solución se escriben automáticamente en MetaData
      • Las salidas analógicas o digitales controlan todos los conmutadores de soluciones comunes
  • El navegador de datos muestra todo el experimento en una estructura de árbol
    • Vista previa de la primera señal adquirida
    • Acceso rápido a Paradigm Review, Reanalysis Scope, Metadata e información de rutina
  • Análisis en tiempo real y fuera de línea, incluida la detección de eventos mini/sinápticos y la caracterización del potencial de acción
    • Las mediciones configuradas como parte de las rutinas crean gráficos en tiempo real
    • Las señales virtuales proporcionan al usuario información derivada de señales de entrada físicas, ecuaciones matemáticas, modificación de señales o cualquier combinación de las mismas. Los filtros de paso alto y bajo, la capacidad de amplificador de bloqueo y la sustracción de un barrido de referencia son nuevos en la versión 2
    • Los paradigmas pueden acceder a las mediciones para realizar más análisis en tiempo real
    • Las ecuaciones y las variables proporcionan la máxima flexibilidad.
    • Detección de eventos mediante un algoritmo basado en deconvolución de alto rendimiento
    • Exporta fácilmente datos a Microsoft Excel y otros programas de hojas de cálculo para compatibilidad con los procedimientos de análisis existentes
    • Una gran cantidad de funciones de análisis nativas de Igor Pro
  • Compatibilidad con el modo multiamplificador IPA
    • Se puede conectar una combinación de dos amplificadores IPA® o Double IPA®.
    • Se admiten hasta 16 canales de entrada


































¡NUEVO! Sutter Instrument presenta:

Patch dinámico: una nueva función en el software SutterPatch® y el amplificador de Patch Clamp digital dPatch®


Ventanas de software SutterPatch de SutterLa técnica de Patch dinámico se introdujo por primera vez en 1993 como un método para simular conductancias iónicas en las neuronas durante las grabaciones de Patch Clamp. Este método generalmente implica registrar el potencial de membrana de la célula, transmitir los datos a una computadora, calcular la corriente adecuada que se inyectará en la neurona y enviar este valor al amplificador. La comunicación entre la computadora y el amplificador limita la velocidad a la que se pueden actualizar los cálculos de Patch Clamp. Además, el hardware y el software adicionales necesarios para realizar la sujeción dinámica han limitado su aplicación. Una solución todo en uno ya está disponible como una actualización gratuita del software SutterPatch y el amplificador dPatch para los investigadores interesados ​​en realizar experimentos de sujeción dinámica.

La arquitectura digital patentada del sistema amplificador dPatch proporciona una plataforma ideal para la sujeción dinámica. El dPatch funciona con un sistema en chip que proporciona procesamiento paralelo a través de una matriz de puerta programable de campo (FPGA) y dos procesadores centrales ARM de alta velocidad. Dentro de esta arquitectura se implementan varios modelos sofisticados de sujeción dinámica. En cada modelo, la actualización de los valores actuales aplicados ocurre sin comunicación entre el dPatch y una computadora. Dependiendo de la complejidad del modelo, se pueden lograr velocidades de actualización de hasta 500 kHz.

La simulación de una población de canales dentro de la membrana neuronal implica modelar la cinética de los mecanismos de activación del canal. Estas cinéticas de canales pueden modelarse utilizando múltiples puertas independientes como en el modelo de Hodgkin-Huxley, o un modelo de Markov de múltiples estados. Para los modelos de estilo Hodgkin-Huxley, el dPatch proporciona hasta 16 puertas individuales por canal simulado, con hasta ocho canales simulados ejecutándose simultáneamente por escenario. Para los modelos de Markov, se pueden ejecutar hasta cuatro modelos de 14 estados simultáneamente u ocho modelos con menos estados. Por ejemplo, ocho modelos de 10 estados pueden ejecutarse simultáneamente.

Los valores derivados de las ecuaciones de activación se utilizan luego para calcular la corriente aplicada a la neurona. El cálculo de la corriente puede definirse en términos de conductancia o permeabilidad. Para los modelos de conductancia, el valor definido a partir de los cálculos de activación se combina con el potencial de inversión de los iones que pasan a través de los canales simulados, así como con la conductancia de los canales simulados. Además, los valores de conductancia del canal pueden depender del voltaje. Para los modelos de permeabilidad, el valor definido a partir de los cálculos de activación se combina con las concentraciones intracelulares y extracelulares de los iones que pasan por los canales simulados. Estos modelos simulan las ecuaciones de Goldman-Hodgkin-Katz.

El software SutterPatch es una aplicación de análisis, administración y adquisición de datos intuitiva y con todas las funciones, diseñada para operar en computadoras con Windows o Mac OS. SutterPatch viene incluido con el amplificador dPatch. La interfaz de usuario de Patch Clamp proporciona un mecanismo poderoso para cargar modelos de Patch dinámico. No se requiere experiencia con secuencias de comandos. Las ecuaciones de puerta o las transiciones del modelo de Markov simplemente se ingresan como texto y SutterPatch las interpreta. Los modelos de Clamps dinámicos individuales se guardan en un grupo y se pueden transferir fácilmente entre usuarios. Además, se proporcionan varios modelos de muestra para que los usuarios comiencen, que van desde una simple conductancia de fuga hasta un canal de sodio de 12 estados.

Resumen
Esta actualización gratuita del software SutterPatch y el amplificador dPatch proporciona la primera solución todo en uno para el investigador interesado en realizar experimentos de sujeción dinámica.
Las rápidas tasas de actualización de Patch Clamp son el resultado de la arquitectura digital patentada del amplificador dPatch.
Los modelos compatibles incluyen:
Modelos de conductancia estilo Hodgkin-Huxley
Modelos de permeabilidad estilo Goldman-Hodgkin-Katz
Modelos de Markov
El control del software SutterPatch de la Patch Clamp no requiere secuencias de comandos.
REQUISITOS DEL SISTEMA
PARA SISTEMAS FAMILIARES IPA

Configuración mínima:
Sistema operativo: Windows 10 (64 bits) o posterior, o MacOS: 10.11, El Capitan o posterior1
Procesador: Dual-core i52
Memoria: 3GB
Disco duro: 500 GB o más
Resolución de pantalla: 1024 x 768 (XGA)
1 puerto USB 2.0 de alta velocidad disponible3

Configuración recomendada:
Windows 10 (64 bits) o posterior, o MacOS: 10.11, El Capitan o posterior1
Procesador: Dual-core i52
Memoria: 8GB
Unidad de estado sólido (SSD): 500 GB o más
Resolución de pantalla: 1920 x 1080 (FULL HD)
1 puerto USB 2.0 de alta velocidad disponible3


PARA SISTEMAS dPATCH

Configuración mínima:
Windows 10 (64 bits) o MacOS: 10.11, El Capitan o posterior1
Procesador: Dual-core i52
Memoria: 6GB
Unidad de estado sólido (SSD): 500 GB o más
Resolución de pantalla: 1024 x 768 (XGA)
1 puerto USB 3.0 SuperSpeed ​​disponible (en la placa principal, no en una tarjeta PCIx o similar)3

Configuración recomendada:
Windows 10 (64 bits) o MacOS: 10.11, El Capitan o posterior1
Procesador: Dual-core i52
Memoria: 16GB
Unidad de estado sólido (SSD): 500 GB o más
Resolución de pantalla 1920 x 1080 (Full HD)
1 puerto USB 3.0 SuperSpeed ​​disponible (en la placa principal, no en una tarjeta PCIx o similar)3

Sistema de gestión de adquisición de datos y software de análisis SUTTERPATCH®: Incluido con todos los sistemas amplificadores de instrumentos Sutter

1 Los sistemas operativos instalados en plataformas de software de virtualización como VMware y Parallels no son compatibles.

2 En este momento, WaveMetrics no es completamente compatible con Igor Pro en computadoras Mac basadas en la arquitectura Apple Silicon M1. Consulte https://www.wavemetrics.com/news/igor-and-apple-arm-processors para obtener detalles técnicos. Los experimentos preliminares indican que el software SutterPatch se ejecuta en estas computadoras, tanto con Igor Pro 8 como con 9, y con cada uno de los sistemas de amplificación Sutter conectados. Sin embargo, como con cada nueva tecnología, no podemos excluir completamente las incompatibilidades.

3 puertos USB 3.0 son compatibles con las especificaciones USB 2.0 de alta velocidad.
No se admiten los puertos USB 2.0 de "velocidad máxima" más lentos, que a veces se encuentran en PC con Windows más antiguos o en tarjetas complementarias USB.

Para verificar si hay USB 2.0 o USB 3.0 de alta velocidad en una computadora con Windows, busque en la sección Panel de control > Administrador de dispositivos > Controladores de bus serie universal los controladores de host "Mejorados". Como esto no proporciona ninguna información de asignación a los puertos físicos de la computadora, y puede haber una combinación de versiones de puertos USB, debe verificar los puertos USB individuales para el rendimiento operativo de USB 2.0/3.0 de alta velocidad. Como indicador visual, los puertos USB 3.0 suelen tener un código de color azul.

Los concentradores USB no son compatibles. No se recomiendan las tarjetas complementarias USB, incluso si cumplen formalmente con las especificaciones de alta velocidad o supervelocidad. A menudo están configurados arquitectónicamente como concentradores USB y pueden provocar errores de transferencia intermitentes que son difíciles de solucionar.
El software SutterPatch viene como parte de los sistemas de adquisición y amplificador IPA®, Double IPA®, dPatch® y Dendrite™ e incluye una licencia de Igor Pro 9 de WaveMetrics, Inc. Los instaladores completos disponibles en esta página incluyen Igor Pro 9 y Instalador de Igor Pro 8.

SutterPatch v2.2 (compilación 284); 21 de diciembre de 2021 - Notas de la versión

Instaladores de Windows (Windows 10 o posterior, 64 bits)

Instalador completo para Windows, Igor Pro 9 > Descargar
Instalador completo para Windows, Igor Pro 8 > Descargar
SutterPatch Updater para Windows, Igor Pro 9 > Descargar
SutterPatch Updater para Windows, Igor Pro 8 > Descargar

Instaladores de Macintosh (OS X 10.11 o posterior)

Instalador completo para OSX, Igor Pro 9 > Descargar
Instalador completo para OSX, Igor Pro 8 > Descargar

Notas:

No recomendamos usar SutterPatch Updater para instalar el software SutterPatch sobre una instalación independiente existente de Igor Pro. Si ya tiene Igor Pro 8 o 9 en su computadora, utilice uno de los siguientes métodos para instalar el software SutterPatch:
Utilice el instalador completo para actualizar el Igor Pro existente e instalar SutterPatch.
Desinstale Igor Pro e instale SutterPatch usando el instalador completo. ¡Recuerde hacer una copia de seguridad de sus archivos de usuario de Igor antes de desinstalar!
Cree una segunda instalación de Igor Pro utilizando el instalador completo. Esto solo debe hacerse en casos especiales y no se recomienda.
SutterPatch NO es compatible con Igor Pro versión 6 o 7. Se requiere Igor Pro 8 o 9 de 64 bits. Una licencia de usuario único de Igor Pro 9 viene incluida con el software SutterPatch. Comuníquese con el soporte técnico de Sutter para obtener información sobre la actualización si compró su sistema amplificador IPA con un Igor Pro 7 u 8. Puede ser elegible para una actualización gratuita. Consulte la pestaña Requisitos del sistema para ver la lista completa de requisitos de hardware y software.
El software Igor Pro 9 y SutterPatch v.2.2 se puede instalar además de las instalaciones existentes de versiones anteriores del software Igor Pro y SutterPatch. Todos los ajustes y parámetros son independientes entre versiones.

Prueba de software
Si planea evaluar SutterPatch, puede activar una licencia de prueba de Igor Pro. Después de 30 días, se desactivarán varias funciones, como guardar, imprimir y copiar en el portapapeles.
dPatch Firmware versión 84; 28 de octubre de 2021

Instrucciones de actualización de firmware
Seleccione SutterPatch > Control de hardware > Mantenimiento de dPatch > Actualizar firmware. Luego navegue hasta el archivo binario del firmware (.h5) y siga las instrucciones adicionales. El instalador de SutterPatch coloca el archivo de firmware en:

Windows: Archivos de programa/SutterPatch2/Carpeta de herramientas
Macintosh: Aplicaciones/SutterPatch2/Carpeta Herramientas

Solo descargue este archivo cuando se lo indique el soporte técnico de Sutter.
Descargue la versión 84 del firmware de dPatch
 
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